Caratterizzazione del panorama dei neoantigeni condivisi nel cancro endometriale con mismatch repair deficiency (MMR)

Il cancro endometriale (EC) con mismatch repair deficiency (MMRd) è caratterizzato dall’accumulo di inserzioni/delezioni in siti microsatellitari. Queste mutazioni portano alla sintesi di peptidi frameshift (FSPs) che rappresentano neoantigeni tumorali (nAg) dimostrati essere condivisi tra pazienti/tumori con MMRd.

In questo studio, abbiamo esplorato la possibilità di produrre un vaccino contro il cancro basato su nAg nell’EC con MMRd. Abbiamo adottato un approccio di sequenziamento dell’esoma completo e pipeline bioinformatiche ad hoc per caratterizzare i FSPs in 35 pazienti con EC. È stato identificato un numero medio di 146 ripetizioni mononucleotidiche mutate (MNRs), con arricchimento nel gruppo di pazienti con impairment di MLH1. Un’alta copertura è emersa dall’analisi comparativa degli FSPs dell’EC con il contenuto del vaccino NOUS-209 precedentemente validato. Abbiamo ottenuto evidenze della traduzione degli FSPs come proteine espresse tramite Ribo-seq, supportando il loro potenziale come bersaglio per la vaccinazione.

Lo sviluppo di una strategia vaccinale basata su nAgs nell’EC con MMRd potrebbe essere ulteriormente esplorato.

Titolo originale

Characterization of shared neoantigens landscape in Mismatch Repair Deficient Endometrial Cancer

De Paolis E, Nero C, Micarelli E, Leoni G, Piermattei A, Trozzi R, Scarselli E, D’Alise AM, Giacò L, De Bonis M, Preziosi A, Daniele G, Piana D, Pasciuto T, Zannoni G, Minucci A, Scambia G, Urbani A, Fanfani F. Characterization of shared neoantigens landscape in Mismatch Repair Deficient Endometrial Cancer. NPJ Precis Oncol. 2024 Dec 20;8(1):283. doi: 10.1038/s41698-024-00779-4. PMID: 39706858; PMCID: PMC11662070.