Biobanca e scienze omiche: dai big data alla medicina personalizzata

Dal 2020, è stata istituita all’interno della Fondazione Gemelli la Biobanca di ricerca per la Medicina Personalizzata (Biobanca-FPG), centralizzata all’interno del parco scientifico e tecnologico della Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS. La finalità è contribuire a sostenere oltre alla ricerca di base, preclinica e di traslazionale, anche indagini epidemiologiche supportare – grazie a una adeguata raccolta dei campioni – la sperimentazione clinica.”

Ne parliamo, a qualche anno dall’inizio di questa esperienza, con la Prof.ssa Ornella Parolini (Responsabile Biobanca per la Medicina Personalizzata Fondazione Gemelli IRCCS) cui abbiamo chiesto di guidarci all’interno di un progetto tanto rilevante e innovativo.

“Professoressa, grazie innanzitutto per la disponibilità. Biobanca: che cos’è e perché è importante per le nuove frontiere di cura?”

“La biobanca è un’unità di servizio all’interno di un’istituzione, normalmente di un’istituzione ospedaliera quale appunto la biobanca all’interno della Fondazione Gemelli, che permette di fare la raccolta  e la processazione di  un campione biologico e la sua conservazione. Vediamo di spiegare: il paziente, dopo aver dato consenso informato che il campione biologico possa essere raccolto e conservato in una biobanca, autorizza che il clinico in ospedale raccolga una biopsia ad esempio (ma il campione biologico è il sangue periferico, la raccolta delle feci, la raccolta delle urine e tutto ciò per cui il paziente dà il consenso informato alla raccolta) che sarà conservata nella biobanca per progetti di ricerca.

Perché è importante una biobanca? La biobanca fa da garante tra il paziente e il ricercatore che poi utilizzerà questo campione, perché potrà mettere a disposizione il campione biologico del paziente solo dopo che arriverà un consenso da parte del comitato etico per la realizzazione di quel progetto specifico.

In questo modo si garantisce proprio la qualità del campione stesso e la qualità e della ricerca che poi verrà svolta su questo campione biologico.”


“Possiamo quindi affermare che la Biobanca ci permetterà curarci meglio?”

“Si, certamente, proprio perché avere a disposizione un campione biologico che è stato trattato secondo i più alti standard di qualità permette a questo punto di andare a fare gli studi più appropriati.

La qualità di un risultato è possibile solo partendo da una buona qualità di un campione biologico. Inoltre, questi campioni biologici permettono di andare a fare studi durante un follow-up, per cui i campioni conservati permettono di fare non soltanto uno studio temporaneo ma seguire un paziente durante gli anni, proprio perché questi campioni biologici vengono trattenuti.”

L’importanza dei dati per la ricerca scientifica è confermata dalla Prof.ssa Lorenza Putignani (Direttore UOS Microbiomica, Osp. Bambin Gesù, Roma), cui abbiamo chiesto di aiutarci a comprendere il ruolo delle scienze cosiddette omiche, ecco il suo contributo.

“Si parla molto oggi di scienze omiche. Per un pubblico laico, come viene definito, di che cosa in effetti si parla quando si accenna a scienze omiche?”

“È un nuovo strumento di medicina traslazionale, di medicina personalizzata piuttosto avanzato. Che cosa vuol dire? Vuol dire usare dei dati multidimensionali, cioè che derivano da approcci molto complessi per la caratterizzazione in sequenziamento in scienza proteomica, di scienza metabolomica, di grandi dataset di dati che sono generati attraverso queste piattaforme tecnologiche che generano i cosiddetti big data.

Questi big data vengono poi analizzati, modificati, si dice che vengono armonizzati tra di loro e poi integrati e ci servono proprio come strumento per la caratterizzazione del fenotipo delle malattie. Sono molto note le scienze omiche che sono partite con le scienze oncologiche nelle loro applicazioni in medicina. Stanno traslandosi in modo molto importante in gastroenterologia anche nell’approccio alla comprensione delle malattie infiammatorie intestinali e chiaramente sono state prese a prestito per studiare e caratterizzare il microbioma, tanto che adesso si parla di una disciplina a sé stante che è la microbiomica

Con gli stessi approcci questa disciplina tende a produrre i grandi dati, big data appunto, relativi ai microbioma umani e a trasformarli e trasferirli in utili strumenti per la diagnostica e per la clinica applicata.”

Vogliamo essere ancora più pratici e parlare di quelle che sono le ricadute positive sui pazienti?

“Allora una delle applicazioni di queste omiche è proprio, tra le altre, l’applicazione della microbiomica. Possiamo scrivere degli algoritmi operazionali di trattamento clinico in cui inserire anche le conoscenze omiche che vengono dal microbioma, esemplificate in algoritmi dedicati inseriti in processi sia di predizione sia di trattamento della malattia, secondo dei quadri inseriti in modelli di intelligenza artificiale. In questo modo possiamo studiare sistemi che sono di supporto alla decisione clinica, all’atto clinico. C’è anche un continuum tra lo spettro pediatrico e lo spettro dell’adulto: alcune patologie croniche importanti dell’adulto, come le Malattie Infiammatorie Intestinali (MICI), in realtà si può cominciare a studiarle, e quindi a prevenirne le forme più importanti, già nella prima età.”

“In chiave pratica: ci sono dei sintomi o delle condizioni che devono consigliare a mamme e papà di approfondire determinate condizioni dei loro bambini?”

Certo, ci sono delle sintomatologie del distretto gastrointestinale ma anche al distretto extra gastrointestinale, per cui adesso si parla di medicina olistica proprio perché tutta una serie di sintomatologie che sono, sì, specifiche, possono avere dei tratti generali vanno discussi in prima battuta con il clinico di riferimento, quindi portati in team specialistici multidisciplinari che ne sapranno dare una lettura anche in termini di caratterizzazione omica.”

 

Related Posts

GDPR

  • Avvertenze e Privacy
  • Google Analytics

Avvertenze e Privacy

Chi siamo

Il CEMAD è il centro per le malattie digestive della Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS

L’indirizzo del nostro sito web è: http://www.cemadgemelli.it.

Avvertenze

Il CEMAD precisa che le informazioni presenti nel Sito costituiscono una mera informazione di massima in ordine alle patologie presentate e non sostituiscono in alcun modo l’intervento o l’opinione del medico o la sua diagnosi in relazione ai casi concreti. Conseguentemente si consiglia in ogni caso di contattare il medico di fiducia.

L’accesso e la consultazione di questo sito sono sottoposti ai seguenti termini e condizioni e alle normative vigenti. L’accesso e la consultazione del presente Sito implicano pertanto l’accettazione incondizionata di tali termini e condizioni.

Il Sito e le informazioni in esso contenute e ad esso collegate rivestono esclusivamente scopo informativo e non costituiscono la base per alcuna decisione o azione. Pertanto l’utilizzo del Sito e di ogni altro ad esso collegato sarà sotto la diretta responsabilità e a totale rischio dell’utente.

Il CEMAD compie ogni sforzo per fornire informazioni il più possibile precise ed accurate, tuttavia non si assume alcuna responsabilità né fornisce alcuna garanzia sul contenuto del Sito che deve essere quindi opportunamente valutato dal visitatore.

Il Sito rispecchia in pieno la filosofia del CEMAD.

In particolare, il CEMAD non potrà essere ritenuto responsabile per difetti di accuratezza, completezza, adeguatezza, tempestività delle informazioni contenute nel Sito né per eventuali danni o virus che possano colpire l’attrezzatura informatica o altra proprietà del visitatore in conseguenza dell’accesso, dell’utilizzo o della navigazione del Sito. il CEMAD si riserva il diritto di interrompere o sospendere in qualsiasi momento le funzionalità del Sito senza che ne derivi l’assunzione di alcuna responsabilità a proprio carico.

Le informazioni presenti nel Sito potrebbero contenere errori tecnici o tipografici. il CEMAD si riserva il diritto di apportare in ogni momento e senza preavviso modifiche, correzioni e miglioramenti alle predette informazioni, ai prodotti e ai programmi.

Link

Nel Sito sono inoltre presenti collegamenti (link) ad altri siti di terze parti, ritenuti di interesse per il visitatore. Con il collegamento a tali siti, si esce dal presente Sito per libera scelta e si accede ad un sito di proprietà di terzi, quest’azione sarà segnalata con apertura di una finestra di warning. Le informazioni contenute in tali siti possono non essere in linea con le disposizioni del dlgs 541/92 che regola la pubblicità dei medicinali per uso umano e sono comunque del tutto indipendenti e fuori dal controllo del CEMAD, che non si assume alcuna responsabilità in proposito.
In ogni caso, il CEMAD non assume alcuna responsabilità, né fornirà alcuna garanzia circa la natura e i contenuti di qualsiasi pagina o sito web di terzi connessi al presente Sito mediante links. Tutti gli utenti dovranno quindi prendere atto che il collegamento a siti di terzi avviene sotto la propria responsabilità.

Cookies

Questo sito non utilizza cookies per la trasmissione di informazioni di carattere personale, né vengono utilizzati cookies c.d. persistenti, ovvero sistemi per il tracciamento degli utenti.

Il presente sito sfrutta gli script di “Google Analytics”, anonimizzando appositamente l’indirizzo IP degli utenti; pertanto, i relativi cookies (che non consentono alcuna profilazione), sono da considerarsi meramente “tecnici”.

L’uso dei c.d. cookies di sessione (che non vengono memorizzati in modo persistente sul computer dell’utente e svaniscono con la chiusura del browser) è strettamente limitato alla trasmissione di identificativi di sessione (costituiti da numeri casuali generati dal server) necessari per consentire l’esplorazione sicura ed efficiente del sito. I c.d. cookies di sessione utilizzati in questo sito, evitano il ricorso ad altre tecniche informatiche potenzialmente pregiudizievoli per la riservatezza della navigazione degli utenti e non consentono l’acquisizione di dati personali identificativi dell’utente

Contenuto incorporato da altri siti web

Gli articoli su questo sito possono includere contenuti incorporati (ad esempio video, immagini, articoli, ecc.). I contenuti incorporati da altri siti web si comportano esattamente allo stesso modo come se il visitatore avesse visitato l’altro sito web.

Questi siti web possono raccogliere dati su di te, usare cookie, integrare ulteriori tracciamenti di terze parti e monitorare l’interazione con essi, incluso il tracciamento della tua interazione con il contenuto incorporato se hai un account e sei connesso a quei siti web.

YouTube

Our website uses plugins from YouTube, which is operated by Google. The operator of the pages is YouTube LLC, 901 Cherry Ave., San Bruno, CA 94066, USA.

If you visit one of our pages featuring a YouTube plugin, a connection to the YouTube servers is established. Here the YouTube server is informed about which of our pages you have visited.

If you’re logged in to your YouTube account, YouTube allows you to associate your browsing behavior directly with your personal profile. You can prevent this by logging out of your YouTube account.

YouTube is used to help make our website appealing. This constitutes a justified interest pursuant to Art. 6 (1) (f) DSGVO.

Further information about handling user data, can be found in the data protection declaration of YouTube under https://www.google.de/intl/de/policies/privacy.

Vimeo

Our website uses features provided by the Vimeo video portal. This service is provided by Vimeo Inc., 555 West 18th Street, New York, New York 10011, USA.

If you visit one of our pages featuring a Vimeo plugin, a connection to the Vimeo servers is established. Here the Vimeo server is informed about which of our pages you have visited. In addition, Vimeo will receive your IP address. This also applies if you are not logged in to Vimeo when you visit our plugin or do not have a Vimeo account. The information is transmitted to a Vimeo server in the US, where it is stored.

If you are logged in to your Vimeo account, Vimeo allows you to associate your browsing behavior directly with your personal profile. You can prevent this by logging out of your Vimeo account.

For more information on how to handle user data, please refer to the Vimeo Privacy Policy at https://vimeo.com/privacy.

Google Web Fonts

For uniform representation of fonts, this page uses web fonts provided by Google. When you open a page, your browser loads the required web fonts into your browser cache to display texts and fonts correctly.

For this purpose your browser has to establish a direct connection to Google servers. Google thus becomes aware that our web page was accessed via your IP address. The use of Google Web fonts is done in the interest of a uniform and attractive presentation of our plugin. This constitutes a justified interest pursuant to Art. 6 (1) (f) DSGVO.

If your browser does not support web fonts, a standard font is used by your computer.

Further information about handling user data, can be found at https://developers.google.com/fonts/faq and in Google’s privacy policy at https://www.google.com/policies/privacy/.

Google Analytics

Il presente sito sfrutta gli script di “Google Analytics”, anonimizzando appositamente l’indirizzo IP degli utenti; pertanto, i relativi cookies (che non consentono alcuna profilazione), sono da considerarsi meramente “tecnici”.